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花费了几天时间，将BioInfoServOS的使用手册进行了大幅度更新,手册已经可以下载安装：http://www.bioinfoserv.org/BioinfoServDeb/Version1.1-Xubuntu6.06/help/bioinfoserv-doc_1.1_i386.deb

亦可马上查看：
http://www.bioinfoserv.org/BioLinux/uploads/bioinfoservFAQ/bioinfoserv/

内容列表如下:

一、系统说明

1.系统需求
2.技术支持
3.三维桌面安装启用
4.ADSL/PPPoE 拨号
5.无线网卡
6.网络联接配置
7.输入法切换
8.网络邻居
9.聊天工具
10.telnet "乱码"解决
11.时区选择
12.Windows 桌面..

BioInfoServ Live DVD 1.1光盘映像是基于Live CD 1.1(xubuntu 6.06/Hiweed desktop 1.01)制作的，因此跟原来的BioInfoServ Live CD 1.1的关系就是预置了j精选软件并进行了一定程度的系统加强，这主要是为新用户烤制而成的。不过，这个Live DVD映像采用了BioInfoServ Live CD 2.0的gdm登录界面，预示2.0将很快释放，如后面是相关图片：

生物软件

基因组注释浏览工具：appollo;
序列工（分析、处理、浏览工具）：arb，seaview, DDV oneD,blixem;
P2P分布式分析服务工具：chinook, magnus, BOINC Manager;
序列比对分析：blast，clustx..

再增加几个wine技术软件，它们是：

IE浏览器bioinfoserv-InternetExplorer：
http://www.bioinfoserv.org/BioinfoServDeb/Version1.1-Xubuntu6.06/browser/bioinfoserv-InternetExplorer_6.0.2800.1105_i386.deb

程序代碼编辑器bioinfoserv-Notepad++：
http://www.bioinfoserv.org/BioinfoServDeb/Version1.1-Xubuntu6.06/files/editors/bioinfoserv-Notepad++_4.7.5_i386.deb

网页下载利器bioinfoserv-webdup：
[url]http://www.bioinfoserv.org/BioinfoServDeb/Version1.1-Xubuntu6.06/files/filestranfe..

由于crossOver pro 6.2的释放，现在运行一些windows下的软件更为流畅，现释放几个通过wine技术运行十分流畅的几个windows软件：

flashget 1.9.2.1028通过打包后的软件名为bioinfoserv-flashget
foobar2000通过打包后的软件名为bioinfoserv-foobar2000
UltraEdit-32通过打包后的软件名为bioinfoserv-UltraEdit-32

这几个运行需要先安装bioinfoserv-crossoverOffice-6.2。如果你想尝试，以下是这几个软件包的地址：
http://www.bioinfoserv.org/BioinfoSer ... over-pro_6.2.0-1_i386.deb
[url]http://www.bioinfoserv.org/..

将重整BioInfoServDeb仓库，使之能运行于Rays2.0上，并能有良好的菜单呈现。这些Debian Linux系统将包含：

标准Debian系统
rays2.0系统
ubuntu系统6.06，7.10，8.04系列（Kubuntu, ubuntu, xbuntu,Hiweed Linux）

经过努力地测试，BioInfoServ LiveCD 1.1正是提供下载使用。

BioInfoServ Live CD1.1在原由BioInfoServ Live DVD1.01的基础上进行了修正。本次修正，降低了整个Live CD的体积大小（现有的Live CD其ISO文件大小为668.8M)，以适应CD光驱的使用与安装。

BioInfoServ LiveCD 1.1 ISO下载：点击下载。您可以使用光盘刻录软件刻录ISO成为光盘后使用，也可以使用
[url=http://www.bioinfoserv.org/BioLinux/modules/PDdownloads/singlefile.ph..

BioInfoServOS Deb的软件仓库源，大家可以编辑您的/etc/apt/sources.list,并加入以下地址：

deb http://www.bioinfoserv.org/BioinfoServDeb/Version1.1-Xubuntu6.06/ /

然后，采用新得立管理器，更新软件仓库，或者采用命令apt-get update，随后，大家可以采用新得立管理器来安装bioinfoserv的软件包。

值得注意的是：

bioinfoserv -xfce4_4.3.99.1-bioinfoserv-1.1_i386.deb，bioinfoserv- xfdesktop_4.4.0-bioinfoserv-1.1_i386.deb，bioinfoserv- menu_2.1.27_i386.deb，bioinfoserv-base-directories_1.1-22_i386...

有人问，能不能在xubuntu 6.06版本或其延伸版本获得BioInfoServOS软件特性？

现在可以肯定告诉大家，完全没有问题，请查看其具体解决办法

这个方案已经经过测试，大家放心使用。

值得注意的是，这个方案目前只适合xubuntu 6.06为基础的版本，至于是否能安装到其他ubuntu版本，这不做保证。同时，这与通过BioInfoServOS Live DVD安装获得软件特性没有本质差别，即使的差别，就是改变了软件安装的路径和系统菜单类别的细微变化。

以前一直都计划制作一个英文站点，以英文发布BioInfoServOS的信息。终于今天开工了，风格采用imago03，并修改确定下来，感觉还不错。有兴趣的，请大家前去浏览，顺便帮我指出其中可能的英文错误和不地道的英文表达。

http://www.bioinfoserv.org/en

当然这个英文站点，在原来的站点首页有相应的连接。这样以来，尽量将两个不同语言的站点专门化，尽量避免中文和英语表达语言的混用。

目前已经采用 bioinfoserv-base-directories_1.0-20_i386.deb来替代bioinfoserv- desktopmenu_1.0.1.1_i386.deb所具有的功能。同时修正各个软件在synaptic中的类别显示，统一采用 BioInfoServ类别。

新增加几个软件包：

序列组装：bioinfoserv-lucy_1.19p-3_i386.deb，
系统发育：bioinfoserv-phylip_3.65-2_i386.deb，
hiweedlayer兼容层：bioinfoserv-hiweedlayer_0.0.6-x86_i386.deb，
个人财务管理：bioinfoserv-gnucash-common_1.8.12-6_i386.deb，bioinfoserv-gnucash_1.8.12-6_i386.deb
usb磁盘加载和数据拷贝工具：bioinfose..

1. bioinfoserv-desktopmenu_1.0.1.1_i386.deb
这是针对BioInfoServOS的系统菜单修订文件，安装它可以将您的系统程序菜单添加生物软件方面的类别，同时，为了让系统程序菜单在显示上又条理，还对其中的一些涉及到的其他软件类别进行归类和编修。总之，是为了美化的作用。这个包适合于xfce4桌面。

2.bioinfoserv-themes_2007-13-07_1.3_i386.deb

这个文件针对系统的图标、风格，以及启动动画，登录界面进行美化。适合于GNOME/xfce4/KDE桌面，不过由于制作上的不全面性，仅仅对xfce4桌面支持要全面些。

3.bioi..

目前已经释放的BioInfoServ系统deb已经达到30个，其中生物软件20个（版本可以适用于debian3.0/Ubuntu6.06以上的系统)，其他相关于系统和网络的软件10个（适合ubuntu 6.06)。

具体见http://www.bioinfoserv.org/BioinfoServDeb

BioInfoServOS生物软件包目前放置在

http://www.bioinfoserv.org/BioinfoServDeb

更多的生物软件将逐一deb打包并更新上传，请大家留意。一旦该生物软件仓库具备一定规模，将给出apt安装资源。

目前的这几个包以xfce4桌面为基础(适合gnome和kde桌面的还在制作中），有关于桌面theme( icons, GDM theme, splash等）的，文献管理，序列分析，基因组注释等。

如果要安装，请先下载bioinfoserv-base-directories_1.0-20_i386.deb安装，然后再一次下载安装其他的软件包。

值得注意的是，基于java的生物软件，默认采用sun-jav..

今日开始正是修改定制来自Bio-Linux的软件包，采用的命令有(以bio-linux-base-directories_1.0-20_i386.deb为例）
biowee@BioInfoServOS:~$
dpkg -e bio-linux-base-directories_1.0-20_i386.deb /home/biowee/BioInfoDeb/bio-linux-base-directories/DEBIAN

biowee@BioInfoServOS:~$
dpkg -x bio-linux-base-directories_1.0-20_i386.deb /home/biowee/BioInfoDeb/bio-linux-base-directories

修订/home/biowee/BioInfoDeb/bio-linux-base-directories/DEBIAN中的各个文件配置，以及/home/biowee/BioInfoDeb/bio-linux-base-directo..

今日将系统中到程序菜单进行了又一次的更新（主要是重新修订了其中的类别），同时剔出了部分软件，新增了部分更有特色的软件。这给下次发布新的版本做了有意义的铺垫。

如果您需要现在更新这个菜单，那么请到ftp://www.bioinfoserv.org/bak中下载：

ftp://www.bioinfoserv.org/bak/xfce-registered-categories.xml.zh_CN

ftp://www.bioinfoserv.org/bak/applications.tar.gz

然后将xfce-registered-categories.xml.zh_CN覆盖到/etc/xdg/xfce4/desktop下，而applications.tar.gz解压缩后，将原来/..

今日开始利用apt-apt-mirror镜像以下源，一旦镜像完成，将开放使用：

#Bio-linux4
deb http://envgen.nox.ac.uk/bio-linux/ unstable bio-linux

#hiweed-linux
deb http://archive.ubuntu.org.cn/ubuntu-cn/ dapper main universe multiverse restricted

#beryl
deb http://download.tuxfamily.org/3v1deb dapper beryl-svn

#google
deb http://dl.google.com/linux/deb/ stable non-free

#xfce4
deb http://ubuntu.tolero.org/ dapper xfce-4-4-0
deb-src [url]http://u..

终于将这个Audacious播放器进行了修正。注意这个修正不完美，需要你有心里准备。如果不想因为它而导致其它一些问题，那么目前不建议您采用这种方式修正：

后果：
1. 会去掉系统默认的 libc6的版本
2. 可能会导致系统汉语支持方面的故障，如某些程序里不能调入汉字输入法。
3. 某些程序不能完美支持汉字的显示，如终端，Basket等。

Audacious是需要libmcs的支持，然而，采用系统默认的软件仓库无法找到这个软件包(如果您找到了，那么请留言在其后，谢谢），现在请您下载以下软件包：
[url]http://www.bioinfoserv.org/softwares/DebPa..

经过努力搜寻，查询到目前全世界在生物信息方面构建的相关系统有如下几类：

第一类：基于RedHat（http://www.redhat.com）/Fedora（http://fedora.redhat.com）：

BioLinux ：http://www.biolinux.org
BIOrpms ：http://apt.bea.ki.se
BioLand ：http://bioland.cbi.pku.edu.cn
BioBrew：http://www.biobrew.org
Biopackages.net：http://www.biopackages.net
BiDE：http://bio.macfast.org/bide/

第二类：基于Debian ([url]http://www.d..

为了更好地提供站点服务，现在已经启用新的域名：www.bioinfoserv.org. 请大家更新收藏标签。原来的动态域名http://bioinfoserv.3322.org 同时还提供访问。

重庆直辖10年庆典，将有4天的大假，这个时间里将会启动新的修正版本，届时将一并制作新的英文版本。可能涉及到的：

1. 新的安全升级和内核更新
2. 新的生物信息软件的加入
3. 剔除其中运行不太稳定的软件
4. 英文版本（全英文程序菜单）的制作
5. 支持站点的全英文制作

将来将要进行的工作：

1. 标记所有具有版权信息的软件
2. 新的系统使用说明文档制作
3. 生物（信息）软件仓库的制作
4. 生物（信息）软件管理器的启用和制作

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